GENEL JEOLOJİ ve TEKTONİK : Bölgenin civarının stratiğrafisi, temeli Paleozoyik yaşta şistler ve Mesozoyik yaşlı kristalize kireç taşları oluşturmaktadır. Bunların üzerine diskordan olarak neojen yaşlı çökeller gelir. Bu birimleri iki ana grupta toplayabiliriz.
NEOJEN ÖNCESİ FORMASYONLAR - Metamorfik Şistler : Paleozoyik yaşlı olup,sahanın güneyinde yer alır.
- Kristalize kireç taşları : Sahanın kuzeyinde,doğusunda ve batısında geniş yayılım gösterir . Mesozoyik yaşlıdır.
NEOJEN FORMASYONLARI
- Sekköy Formasyonu : Sahadaki kömürlü formasyonu karakterize eder. Linyit horizonunun üzerinde marn-kireç taşından oluşan örtü birimleri yer alır.
YAPISAL JEOLOJİ Çöküntü sahası olan havzada fay tektoniği gelişmiştir. Kenar fayları neojen öncesinde var olup neojenin doldurduğu çukurun oluşmasına neden olmuştur. Sekköy linyit sektöründe KB - GD doğrultulu iki fayın varlığı tesbit edilmiştir. Fayların güney blokları düşmüştür. İkizköy linyit sektörünün Karacaağaç bölümünde kuzey doğu - güneybatı doğrultulu ve kuzeye doğru yönlenen ve kuzey batı – güney doğu doğrultulu bir fay da son bulan iki fay vardır.
TARİHSEL JEOLOJİ Sekköy – İkizköy neojen sahası Milas İlçesinin güney doğusunda yer alır. Havzada metamorfik şistin ve mesozoik yaşlı kristalize kireçtaşlarının oluşumundan sonra miosen başlarına kadar deniz çekilmiş ve saha su üstünde kalmıştır. Orta ve üst miosen de mevcut çukurlukları yer yer konglomera ve daha çok kum , silt , kilden ibaret çökeller doldurmuştur. Bir süre sonra yer altı su seviyesinin yükselmesi ile bataklıklar oluşmuştur. Bu bataklıktaki sık bitki örtüsü 30 m'ye varan kalınlıkta linyit oluşmasına neden olmuştur. Bitki örtüsünün az ve steril malzemenin çok olduğu yerlerde linyit kalınlığı azdır. Bataklıkların sonradan derinleşip göller meydana gelmesi sakin bir ortamda bataklık bitkilerinin üzerine marnlardan oluşan çökellerin gelmesi ile havzada kömürleşme olayı devam etmiştir. Zamanla göller sığlaşmış yer yer kireçtaşı teşekkülü oluşmuştur. Sonra pliyosende göller kurumaya başlamış iklim kuraklaşmış, civardaki alanlarda erozyon sonucu marn konglomera , kum , çakıldan ibaret karasal kökenli çökeller oluşmuştur. Daha sonra pleistosende meydana gelen tektonik hareketler sonucunda sahada çeşitli kırıklar oluşmuş ve günümüze kadar devam eden erozyonlar ile bugünkü topoğrafya ortaya çıkmıştır.
